Durante el período de seis años del Plan Estratégico de la OPS 2020–2025 (PE), se implementaron tres presupuestos por programas, correspondientes a los bienios 2020–2021, 2022–2023 y 2024–2025. Los Estados Miembros aprobaron un presupuesto total de US$2,35 mil millones, de los cuales el 85% se destinó a los programas básicos y el resto a programas especiales y emergencias. La OPS logró asegurar el 99% del financiamiento aprobado y alcanzó una tasa global de ejecución del 93%, lo que refleja un sólido desempeño en la ejecución a lo largo del período.
Los niveles presupuestarios se incrementaron significativamente en 2022–2023 como respuesta a la pandemia de COVID-19, impulsados en gran medida por un aumento temporal del financiamiento para emergencias y programas especiales, y posteriormente disminuyeron en 2024–2025 a medida que el financiamiento retornó a niveles más típicos posteriores a la pandemia. Los presupuestos de los programas básicos mostraron un crecimiento sostenido en todos los bienios, apoyando la continuidad de la cooperación técnica, mientras que los programas especiales presentaron mayor volatilidad debido a su dependencia de fondos con destino específico y vinculados a emergencias.
